No todas las personas en la población de bacterias son las mismas. Algunos pueden estar al borde de la división celular, otros están distinguiendo, otros están protegiendo para cambiar las condiciones ambientales. Especialmente con respecto a los patógenos, es importante que los investigadores comprendan esta diversidad en la población bacteriana. Este conocimiento puede ayudar a desarrollar un mejor tratamiento.
Una tecnología que ayuda a analizar la diversidad bacteriana es Transcromix de una sola célula. Utiliza pequeñas moléculas de mensajería (ARNm) para determinar qué genes están activos en células bacterianas individuales de la población en un lugar particular en una ubicación particular. Incluso en grupos bacterianos complejos, el análisis de ARNm muestra cómo reaccionan las células bacterianas individuales ante los antibióticos u otro cambio climático.
Publicar en la revista “Protocolo de la naturaleza”
Investigadores de Julius-Meximilians-Urosites (JMU) e investigadores de la investigación de infecciones basadas en ARN (HIRI) en Worzberg desarrollaron una variable moderna de trasplantes bacterianos unicelulares en 2020.
Desde entonces, investigadores de Verzberg han mejorado sus procedimientos desde entonces. En el diario Protocolo de la naturalezaAhora, ofrecen un protocolo paso a paso, a saber, las pautas precisas para hacer transcriptomas bacterianos individuales con MATQ-Seeq. El protocolo también incluye análisis experimental y dirigido por computadora.
Incluye el 95 % de las bacterias utilizadas en el protocolo
“Hemos desarrollado un fuerte protocolo bacteriano Scrnase basado en el entorno de un ARN cuantitativo de una sola célula”, dice la Dra. Cristina Hamburger, un Instituto JMU de Biología de Infección Molecular, que ahora se encuentra en la Universidad de Basilea Basilea. El científico y su colega de JMU, el Dr. Fabin Amadhul, es el primer autor del estudio.
“Para usar la biología del modelo Salmonella interacánicaMostramos que este procedimiento es muy efectivo “, Cristina explica la hamburguesa. Recibe una tasa muy alta de retención celular del 95 %, lo que significa que al final de este proceso, las bibliotecas de genes individuales en realidad se producen a partir del 95 % de las células utilizadas al principio, con una pérdida más alta del 70 %.
Se analiza la actividad de 300 a 600 genes
“Nuestro método”, nuestro método, detecta de 300 a 600 genes por actividad de células bacterianas, en promedio, es significativamente más alto que en otros métodos en este momento. “Según la actividad del gen registrado, es muy fácil entender lo que está haciendo actualmente la bacteria individual o las condiciones ambientales en las que actualmente está protegiendo.
Todos los procedimientos demoran aproximadamente cinco días con aislamiento solitario a la generación de datos sin procesar-MATQ-Seeq durante casi cinco días. Es ideal para cientos de patrones pequeños de células. En este sentido funciona con una resolución muy eficiente y alta. Millones de células son más adecuados para un alto golpe de células, otros protocolos en los límites de millones de células, lo que causa más daño a las células y debe aceptar la detección de menos de 100 genes por célula.
Plataforma única a nivel mundial para cooperación
“Nuestro protocolo permite un análisis sólido de varias especies bacterianas y, por lo tanto, sentó la base para el desarrollo de la plataforma de continuidad de ARN de células individuales única única a nivel mundial en Verzberg”, explica el director de Harry y IMIB, el profesor Jorg Vogel. El propósito de esta plataforma es fortalecer el protocolo y la experiencia, haciendo que la tecnología sea accesible para otros investigadores y laboratorios.
La nueva plataforma se llama Centro del ARN de células individuales microbianas, ver (Micros que): “Se basa en la tecnología que hemos desarrollado para la transcripción de bacterias individuales y otros métodos de alto óptico”. En el futuro, los grupos de investigación en todo el mundo podrán acceder a tecnologías para las células de células bacterianas de células bacterianas.
